Gewebe Microarrays
Gewebe Microarrays eine Einleitung:
Gewebe microarrays (TMAs) werden benutzt, um den Ausdruck der Gene in den mehrfachen einzelnen Gewebeproben auf einem Plättchen gleichzeitig zu analysieren. TMAs bestehen aus den kleinen 0.6 - 3.0 Millimeter Kernen des Gewebes von den Spendergewebeparaffinblöcken, die an einer hohen Dichte auf einem Plättchen gekleidet werden.
Technologie-Einblick: Kennzeichen von biomarkers mit microarray Technologie Jena M Giltnane und David L Rimm Natur-klinische Praxis-Onkologie (2004) 1, 104-111 des Gewebes
Gewebe Microarrays haben Gewebe traditionelle Analyse der herkömmlichen histologischen Paraffinblöcke werden lassen miniturized und Hochdurchsatz.
Histochemische und molekulare Abfragung Techniken können auf den TMA Plättchen verwendet werden und lassen folglich TMAs die leistungsfähigen Hilfsmittel sein, zum des Genausdruckes zu überprüfen, der in den Krankheitzuständen über einer Vielzahl der Patienten und der Krankheitzustände ein Profil erstellt.
Gewebe Microarray Inhalt
Eigenschaften der Gewebe-Reihen
Eigenschaften des Gewebes Microarrays:
- 50 - 500 Gewebe oder können pro Plättchenblock mehr analysiert werden
- hoher Durchsatz
- verhältnismäßig niedrige Kosten
- kann mit einer Vielzahl der Flecke wie, die H u. E befleckt werden befleckt werden
- Plättchen können mit einer Breitvielzahl von Techniken analysiert werden
- automatisierte Analyse und Datenerfassung mit vielen Techniken
Gewebe Microarray Synthese:
Gewebe Microarrays werden mit einem Microtome produziert, der Gewebe in die Kapitel mit 4 - 5 Mikrometern unterteilt (siehe Abbildung 1 oben). Diese entkernen Gewebebiopsiekapitel werden genommen von den spezifischen Bereichen des Interesses von Paraffin-eingebetteten Gewebeblöcken. Diese cynlindrical Kerne des Gewebes werden in gekleidete unbelegte aufnahmefähige Blöcke Re-eingebettet. Mit dieser Methode können mehr als 500 Gewebekerne auf einem einzelnen Plättchen gekleidet werden! Der Vorlagenblock wurde von Konenen et al. entwickelt.
Anwendungen des Gewebes Microarrays:
- Immunohistochemistry
- Beflecken von: H U. E, HC, ISH,
- In-situhybridation
- Leuchtstoff in-situhybridation (FISCH)
- In-situ-PCR
- RNS- oder DNA-Ausdruck Analyse
- TUNEL Probe für apoptosis
- Morphologische und klinische Kennzeichnung vieler geduldiger Gewebe
Vorteile der Gewebe-Reihen oder der Gewebe-Chips:
- Experimentelle Gleichförmigkeit
- Erlaubt Verstärkung (und Erhaltung) der knappen Gewebeproben
- Sichern des Probe Datenträgers
- Verringert die Zahl den überprüften Plättchen (herkömmliches Plättchengewebeparaffin)
- Hoch-Durchsatz
- Analyse kann automatisiert werden und Daten können automatisiert werden
Typen des Gewebes Microarrays:
Cryo - Gewebe Microarrays: Cryo-TMAs benutzt gefrorene Gewebe, die in einem optimalen Schneidetemperaturmittel eingebettet werden. Diese cryo-TMAs, die zu ihrem Einfrieren passend sind, sind Formalin reparierten Geweben für RNS- und Proteinanalyse überlegen. Auch Antikörper bearbeiten viel betterl mit gefrorenen Geweben.
Multi-Tumoren Gewebe Microarrays : Multitumor TMAs haben viele unterschiedliche Typen Gewebe, die auf dem Plättchen ausgerichtet sind. Die Technik wurde zuerst von Kononen et al., 1998 verwendet. Kononen benutzte diesen Typen von TMA, um 6 Genverstärkungen zu entdecken, p53, das Ausdruck auch im Brustkrebsgewebe überprüft wurde.
Weiterentwicklung Gewebe Microarrays: Dieser Typ des Gewebes microarray überprüft unterschiedliche Stadien der Weiterentwicklung des Tumors (oder Krankheit) innerhalb eines gegebenen Organs. Z.B. Prüfung der Tumoren in der Brust. Diese Plättchen können für Markierungen des Interesses dann geprüft werden, oder biochemische Analyse der Proben kann erfolgt werden.
Prognose-Gewebe Microarrays: Krankheitproben wie Tumorbiopsien können von den Patienten genommen werden und überprüft werden. Diese Proben können für klinische Anschlüsse benutzt werden, um die Weiterentwicklung des Patienten zu überwachen. Daten werden dann mit anderen klinischen Daten analysiert und verglichen.
Gewebe Microarray Software und Bioinformatics:
Software-Hilfsmittel für Hoch-Durchsatz Analyse des Gewebes Microarrays: Archivierendes und Datenanalyse Bild
Enthält die folgende Software:
TMA-Deconvoluter und Stainfinder. Das deconvoluter wandelt rohe zählende Bogen vom Gewebe 3-D Microarray Plan in ein 2-D Tabelliertabelle Format um, das für weitere Datenanalyse verwendbar ist.
Gewebe-Reihe Datenanalyse : Software zum Erstellen einer interaktiven Datenbank für TMA Bildbetrachtung und Dateneingabe.
TAD: Gewebe-Reihe Datenbank- Software für Download.
TMAJ : Set Software-Hilfsmittel verwendete, Gewebe MicroArray (TMA) Daten und Informationen zu handhaben.
Ursprüngliche Gewebe Microarray Bezugspapiere:
Battifora H: Der multitumor (Wurst) Gewebeblock: Romanmethode für die immunohistochemical Antikörperprüfung. Labor Investieren 1986, 55:244-248.
Kononen J, Bubendorf L, Kallioniemi A, Barlund M, Schraml P, Leighton S, Torhorst J, Mihatsch MJ, Sauter G, Kallioniemi OP: Gewebe microarrays für Hochdurchsatz das molekulare Ein Profil erstellen der Tumorprobenmaterialien. Nationales Med 1998, 4:844-847.
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