Eine globale Auswertung der microarray engagierten Datenbanken. Pdf. Sophie Lemoine. - [gelesen mehr]

Die Reihe Klon-Informationen Datenbank (SÄURE) ist ein auffindbares Hilfsmittel zu Information über Menschen, Maus und Ratte, die DNA klont. Jeder Klon enthält Informationen über das zugewiesene UniGene cluster(s), Standort in der in voller Länge Abschrift, Genontario zugewiesen - [gelesen mehr]

Erlaubt Wechselbeziehung der GeneChip Reihe Resultate mit Reihe Design und Anmerkung Informationen; stellt Zugriff zu den Reihe Inhalt Informationen, einschließlich Prüfspitze Reihenfolgen und Genanmerkungen zur Verfügung; freie Registrierung wird benoetigt. - [gelesen mehr]

Allgemeiner Behälter für microarray gegründete Genausdruck Daten; enthält mehrere curated Genausdruck Datensätze. - [gelesen mehr]

ArrayPipe erlaubt Benutzern, eine verarbeitenrohrleitung für die Analyse von microarray Daten anzupassen. Schließt Methoden für Qualitätseinschätzung der Plättchen, der Datensichtbarmachung, der Normalisierung und der Abfragung der differential ausgedrückten Gene ein. Ausgabe besteht aus repor - [gelesen mehr]

ArrayProspector ist ein Set vorausgesagte Funktionsverbindungen zwischen Genen, die von den microarray Ausdruck Daten von der Standford Microarray Datenbank geschlossen worden sind. Benutzer können nach den Genen, die, um gebunden werden abzufragen oder nach Links zwischen zwei Genen suchen. - [gelesen mehr]

ArrayXPath ist ein Web-gegründeter Service für das Zusammenbringen der microarray Gen-Ausdruck Profile mit bekannten biologischen Bahnen. Input ist ein gebündeltes Gen-Ausdruck Profil in einem Tabulator-abgegrenzten Textformat. Ausgabe schließt Bahndiagramme ein. - [gelesen mehr]

UNTERSEITE - BioArray Softwareumgebung. GRÜNDEN Sie eine freie Web-gegründete Datenbanklösung für die massiven Daten, die durch microarray Analyse festgelegt werden. Freigegeben unter GNU Öffentlichkeit Lizenz. - [gelesen mehr]

Reihe Extraktion und Analyse der diesseits-Regelnden Regionen (BEARR) nimmt eine Liste der Genkennungen (wie RefSeq und Unigene Identifikation), der Übereinstimmung Muster und (beliebig) der Position Gewichtmatrix als Input und Rückkehr eine Liste der Übereinstimmungen für die Muster in BOT - [gelesen mehr]

Bingo ist ein Java-gegründetes Hilfsmittel, zum festzustellen, welche Gen Ontology (GEHEN Sie), Kategorien overrepresented statistisch in einem Set Genen oder in einem Subgraphen eines biologischen Netzes sind. - [gelesen mehr]

Bioconductor ist eine geöffnete Quelle und geöffnetes ein Programmentwicklungssoftwareprojekt, das darauf abzielt, Zugriff zu einer breiten Strecke der leistungsfähigen statistischen und graphischen Methoden für die Analyse von genomic Daten zur Verfügung zu stellen. - [gelesen mehr]

Server, der stromaufwärts von Genen im gleichen Genausdruck Block für regelnde Reihenfolge Motive mit einer Gibbs Musterstückstrategie absucht. Das Markov Hintergrundmodell wird für Nichtmotiv Unterseiten benutzt und verbessert Besonderheit der vorausgesagten Motivstandorte. - [gelesen mehr]

Das MGuide (Version 2.0). Die braunen Labors führen Anleitung zum Microarraying für den molekularen Biologen durch. - [gelesen mehr]

Treten Sie Informationen, Verwendbarkeit und mit Sachkenntnis der kanadischen microarray Mitten in Verbindung; enthält Labors, die DNA oder Oligonucleotide beschmutzte Reihen und andere Dienstleistungen angeben, und Labors, die analysieren können, RNS mit Affymetrix bricht ab. - [gelesen mehr]

Server, der microarray analysiert und Fördererreihenfolge Daten verbanden mit einer Antwort zu einem spezifischen Auslöseimpuls. Nach Analyse wird ein mögliches transcriptional regelndes Netz erstellt. CARRIE stellt auch fest, welche Übertragungfaktoren wahrscheinliches invol waren - [gelesen mehr]

Die Mitte für Informationen Biologiegen Ausdruck Datenbank (CIBEX) ist ein allgemeiner Behälter für Genausdruck experimentelle Daten. Das Datenbanksystem ist mit dem MIAME Standard gefällig. - [gelesen mehr]

Ein Programm für die Berechnung von von Blockbereicherung Analyse und von von integrierter Sichtbarmachung von Ausdruck, Anmerkung und ÜbertragungDaten der verbindlichen Sites des faktors mit dem Gen Ontology. - [gelesen mehr]

Server, der versucht, alle mögliche Motive zu kennzeichnen, stand auf den Genen in Verbindung, die zu den regelnden Elementen des Anteiles vorausgesagt wurden. Er ändert Gibbs Musterstück durch beeinflussende Suchen in Richtung zu konservierten Reihenfolgen über mehrfachen Sorten. - [gelesen mehr]

Der konservierte Übertragung-Faktor-verbindliche Site-Sucher (CONFAC) nimmt eine Liste der menschlichen Gennamen und -kennungen als Input und vergleicht sie mit ihren Mausorthologues, um konservierte verbindliche Sites des Übertragungfaktors zu kennzeichnen. Weitere Informationen von t - [gelesen mehr]

Datenbank für Anmerkung, Sichtbarmachung und integrierte Entdeckung (DAVID) ist ein Web-gegründetes Hilfsmittel, das zur Verfügung stellt, integrierte Lösungen für die Anmerkung und die Analyse von Genom-einstufen die Datensätze, die von den Hochdurchsatz Technologien wie microarray und proteo berechnet werden - [gelesen mehr]

Diese Web site enthält microarray Analyse Software (Argus und Z-Pool), eine Endothelial Zelle Ausdruck Datenbank und andere Betriebsmittel, die auf Gefäßendotheliumforschung in Verbindung gestanden werden. Sehen Sie die PubMed Auszüge zu mehr Information. - [gelesen mehr]

Doelan ist ein Hilfsmittel, das konzipiert ist, um die Qualität DNA der microarray Produktion zu überwachen. - [gelesen mehr]

Nützlich für die Zusammenstellung des überwiegenden biologischen "Themas" einer gegebenen Genliste. Von einer Liste der Gene von microarray oder von anderem Genom-stufen Sie Experimente, MÜHELOSIGKEIT kann über-Darstellung Statistiken für jede mögliche Gen Ontology Bezeichnung mit Re schnell errechnen ein - [gelesen mehr]

ermineJ ist ein Hilfsmittel für die Analyse der Gensets (benutzerbestimmt oder die vorbei definiert GEHEN Bezeichnungen), in den Ausdruck Daten. Die Software ist konzipiert, von den Biologen mit wenigem oder keinem Informatikhintergrund benutzt zu werden. Eine Befehl-Zeile Schnittstelle ist für Benutzer vorhanden, die - [gelesen mehr]

ExpressDB - eine relationale Datenbasis, die Hefe- und E. Coli RNS-Ausdruck Daten enthält. - [gelesen mehr]

Ausdruck Auswerteprogramm ist eine Web gegründete Plattform für die microarray Datenanalyse, die am EBI entwickelt wird. Dieses Hilfsmittel wird mit der ArrayExpress Datenbank, ein allgemeiner Behälter für microarray Daten integriert. - [gelesen mehr]

Der Gen-Ausdruck Daten-Analysator (GEDA) ist ein Hilfsmittel für das Entdecken des differentialen Genausdruckes in einer Teilmenge Patienten. Er wird zu Krebs-in Verbindung stehenden microarray Studien hergestellt und umfangreiche Optionen für Sichtbarmachung, Klassifikation und Normalisierung anbietet. - [gelesen mehr]

GeneX-Lite - eine Klient Software-Anwendung, die eine Schnittstelle zu den relationale Datenbasis managment Systemen (RDBMS) bereitstellt. Die Anwendung Schnittstelle erlaubt dem Benutzer, Genausdruck Daten zu laden, zu handhaben, zu analysieren, sichtbar zu machen und abzufragen. RDBMS liefert Speicherung der Daten und der analysis/visualization Resultate. Geben Sie Download frei. NCGR.org - [gelesen mehr]

GenMAPP (Gen MicroArray Bahn-Auswerteprogramm) ist ein microarray Ausdruck Daten-Sichtbarmachunghilfsmittel und erlaubt, daß Daten auf den Karten angesehen werden, die Gengruppierungen und biologische Bahnen darstellen. - [gelesen mehr]

Gen-Ausdruck Sammel: - GEO ist ein Überflußbehälter des Gens expression/molecular, der MIAME gefällige Datenunterordnungen unterstützt, und a curated, Onlinehilfsmittel für die durchstöbernden Genausdruck Daten, Abfrage und Wiederherstellung. NCBI - [gelesen mehr]

Genausdruck und -hybridationreihe Datenbehälter; Onlinehilfsmittel für Wiederherstellung von Genausdruck Daten von irgendeinem Organismus oder von künstlichen Quelle. - [gelesen mehr]

Die Gen-Ausdruck Muster-Analyse Suite (GEPAS) ist eine Ansammlung Hilfsmittel für die Analyse von microarray Daten einschließlich Datenaufbereitung und bündelt, Beispielvergleich, der Datenbergbau, der an gegründet wird, GEHEN Bezeichnungen (FatiGO) und annnotation. Auch geschlossen Hilfsmittel ein - [gelesen worden mehr]

Genom-integrierter Funktionsentdecker (GFINDer) nimmt eine Liste von gene/clone Identifikation mit Klassifikationinformationen als Input und erlaubt dem Benutzer, die unterschiedlichen Genkategorien in der Liste mit Anmerkungen der verschiedenen Typen von einigen unterschiedlichen zu kennzeichnen - [gelesen mehr]

Gen-Ontology automatisiertes Lexikon (ZIEL) ist ein Hilfsmittel für die Funktionsanalyse von Daten von den SAGE und microarray Experimenten. Gen Ontology Bezeichnungen werden als die Grundlage für statistische Analyse verwendet. - [gelesen mehr]

GoMiner organisiert und erlaubt die Sichtbarmachung der großen Sets Gene, die auf Gen Ontology Klassifikationen basieren. - [gelesen mehr]

GoSurfer ist ein Hilfsmittel für das Sichtbar machen und das Vergleichen der Gensets, indem er sie auf Gen Ontology (GEHEN Sie), Informationen in Form eines hierarchischen Baums abbildet. Es ist für das Nachforschen der Resultate der microarray Analysen oder der Genom-breiten Übertragen auf Lochkarten nützlich. - [gelesen mehr]

Software für microarray Bildanalyse. - [gelesen mehr]

HuGEIndex Datenbank. - [gelesen mehr]

KARMA (Keck Reihe Manager und Annotator) erlaubt Sie vergleichen und kommentieren Ihre eigenen microarrays gegen andere vorhandene Reihen. Vergleich von Reihen kann innerhalb der gleichen Sorte sowie über Sorte erzielt werden (Reihe Vergleich basiert auf UniGene Clu - [gelesen mehr]

Multi-Bedingte Hybridation-Intensität Verarbeitungssystem. Ein einlagerndieses konzept der Daten Foki auf dem Zur Verfügung stellen einer Struktur für die statistische Analyse der gesamten Bestandteile der microarray Datenbank einschließlich die experimentellen Anmerkungen. - [gelesen mehr]

MatchMiner ist ein Hilfsmittel, zum der Genkennungen zu vergleichen und umzuwandeln. Benutzer können einzelnes oder Listen der Kennungen von einem Formular zu anderen übersetzen, oder vergleichen Sie zwei Listen der Kennungen als geläufige Genreferenzen. - [gelesen mehr]

maxd - ein Datenlager und eine Sichtbarmachungumgebung für genomic Ausdruck Daten maxdLoad2, maxdView. - [gelesen mehr]

Server konzipierte, Interaktion Protein-DNA Sites auf der niedrigen Paarstufe festzulegen. Gebrauch Chip-kleidet die Daten, Wortaufzählung und Position-spezifische Gewichtmatrix, die aktualisiert, um nach den Motiven zu suchen, die diese Interaktion Sites darstellen. - [gelesen mehr]

MedMiner kann verwendet werden, um Gene von einem microarray Set auszuwählen, das auf GeneCards Informationen basiert. Gegründet auf den Genen wählte ein kann PubMed Auszüge mit bekannten Gensynonymen und anderen benutzerspezifischen Suchparametern dann suchen aus. Die PubMed Suchdose auch - [gelesen mehr]

MIAME (minimale Informationen über ein microarray Experiment) gefälliges microarray Daten-Unterordnunghilfsmittel. - [gelesen mehr]

Gruppe, welche die Entwicklung eines internationalen Behälters für Genausdruck Daten und die experimentellen und Datenbankstandards benötigt für solch eine Bemühung erleichtert. - [gelesen mehr]

MicroArray Projekt-System (KARTEN). KARTEN ist ein MicroArray Projekt-System für das Management und die Deutung der microarray Genausdruck Experimentdaten. NIEHS - Microarray Gruppe - [gelesen mehr]

Protokolle, Analyse und Betriebsmittel; KNALL gegen die gesetzte DNA 15K Bibliothek klont (von 15.000 menschlichen UniGene Blöcken; klont sind vorhanden). - [gelesen mehr]

NOMADE. Ein geöffnetes Quellsystem der Software für die Speicherung und das Abfragen der Resultate der microarray Experimentdaten. UCSF Nomade - [gelesen mehr]

Oligodb legt die oligos fest, die für die Ausdruck Experimente verwendbar sind, die auf vorausgesagten Genabschriften vom Ensembl Projekt basieren. Ein kann nach Abschriften über Schlüsselwort suchen, oder tun Sie eine Reihe Suche, indem Sie eine Liste der Ensembl Kennungen zur Verfügung stellen. - [gelesen mehr]

Auf-Hilfsmittel ist eine Suite der Hilfsmittel für den Datenbergbau, der auf Informationen vom Gen Ontology basiert (GEHEN Sie). Funktionsgruppierungen der Listen der differential ausgedrückten Gene können erstelltes Verwenden sein Auf-Ausdrücken. Enthält Hilfsmittel für das Festsetzen der Funktionsvorspannung für Sets von - [gelesen mehr]

Eine XML-gegründete Java Anwendung wird beschrieben, die einen Funktion-orientierten Überblick über die Resultate der Blockanalyse Gen-Ausdruck der microarray Daten liefert, die auf Gen Ontology Bezeichnungen und Verbindungen basieren. Die Anwendung legt ein HTML page mit listi fest - [gelesen mehr]

Ein Server für die Abfragung, den Vergleich und die Überprüfung der Motive der verbindlichen Sites des Übertragungfaktors in den Förderern. Die POBO Urladenanalyse, die an ein oder zwei Blöcken der Co-geregelten Gene angewendet wird, entdeckt Motive unter extremen Stufen der Darstellung. - [gelesen mehr]

Mit aktuellen Freigaben der genomic Reihenfolge Daten, erlaubt ProbeLynx Benutzern, die Besonderheit der Prüfspitze Reihenfolgen festzusetzen, die für microarray Experimente verwendet werden. Der Benutzer stellt Prüfspitze Reihenfolgen in FASTA oder in Tabulator-abgegrenztem Format zur Verfügung, und ProbeLynx berichtet über Besonderheit innen - [gelesen mehr]

RAB - RNS Überfluß-Datenbank - [gelesen mehr]

Bono, H., Kasukawa, T., Hayashizaki, Y. und Okazaki, Y. GELESEN: RIKEN Ausdruck Reihe Datenbank-Nukleinsäure-Forschung, 30, 211-213 (2002). - [gelesen mehr]

ChemBank ist eine Öffentlichkeit, die Web-gegründete Informatikumgebung, die durch das ausgedehnten chemische Biologie-Programm des Instituts erstellt wird. Diese Wissen Umgebung schließt frei die vorhandenen Daten ein, die von den kleinen Molekülen und von den Kleinmolekül Bildschirmen berechnet werden. ChemBank soll die Chemiker führen, die Romanmittel oder -bibliotheken, zu den Vorlage Biologen synthetisieren, die nach kleinen Molekülen suchen, die spezifische biologische Bahnen stören, und den Prozeß katalysieren, durch den Drogejäger neue und wirkungsvolle Medizin entdecken. - [gelesen mehr]

Hilfsmittel für das Verweisen von von microarray Daten berechnete von der unterschiedlichen Sorte und über unterschiedlichen Ausdruck Analyse Plattformen. Aufgebaut, die Analyse von ESTs, von TIGR Gen-Index (TGI) und Eukaryotic Gen Orthologs (EGO) von Datenbanken verwendend. - [gelesen mehr]

Eisen Laborsoftware für die microarry Bildübersetzung, Analyse und Sichtbarmachung; vorhanden für Download für nur Fensterplattformen; geben Sie mit Registrierung für nicht gewerblichen Gebrauch frei. - [gelesen mehr]

Stanford Onlineuniversalhilfsmittel für klont und ESTs vereinigt öffentlich die vorhandenen Daten, die geläufig für jeden möglichen Klon, GenBank Zugang oder Gen vom Menschen, Maus, Ratte gesucht werden. - [gelesen mehr]

SMD speichert die rohen und normalisierten Daten von den microarray Experimenten, sowie ihre entsprechenden Bilddateien. Zusätzlich stellt SMD Schnittstellen für Datenwiederherstellung, Analyse und Sichtbarmachung zur Verfügung. - [gelesen mehr]

Eine Liste der öffnen-Quellenanwendungspakete vorhanden für freies vom Institut für Genomic Forschung (TIGR). - [gelesen mehr]