Protein Microarrays Protein Microarrays
Visit Molecular Station for a great article on Antibody and Protein Microarrays Besøg Molekylær Station til en stor artikel om antistof og Protein Microarrays
Protein Chips: Protein Chips:
Protein Microarrays can be based on any ligand-binding assay that relies on the formation of product with an immobilized capture molecule and a target molecule present in the solution. Protein Microarrays kan baseres på nogen ligand-bindende assay, og som bygger på dannelsen af produktet med en immobiliseret capture molekyle og et mål molekyle til stede i opløsningen. These assays can be miniturized and placed on a protein microarray chip. Disse assays kan miniturized og anbringes på et protein microarray chip.
Protein microarrays are now becoming very popular due to their possible future applications in the study of nucleic acid-protein, protein-protein, ligand-receptor, drug-protein target, and enzyme-substrate interactions. Protein microarrays er nu ved at blive meget populær på grund af deres mulige fremtidige anvendelser i studiet af nukleinsyre-protein, protein-protein, ligand-receptor-, narkotika-protein-målet, og enzym-substrat interaktioner.
Types of Capture Molecules for Protein Microarray Chips. Typer af Capture molekyler til Protein microarray Chips. To analyze protein interactions with other molecules, protein microarrays can have various types of molecules immobilized on the slide surface to act as capture molecules in the protein microarray assay. At analysere protein interaktioner med andre molekyler, protein microarrays kan have forskellige former for molekyler immobiliseret på slide overfladen til at fungere som opsamlings-molekylerne i protein microarray analyse.
Figure 1 Illustrates the most common protein array, the antibody microarray. Figur 1 illustrerer de mest almindelige protein array, antistof microarray. Antibodies are spotted onto a glass slide. Antistoffer er plettet på en glas-slide. Two cell lysates with proteins labeled with Cy3 and Cy5 (for example, cancer vs normal) are added as a solution onto the protein array. To celle lysates med proteiner mærket med Cy3 og Cy5 (for eksempel kræft vs normalt) er tilføjet som en løsning på det protein array. Signals are detected from the two different signals. Signaler er detekteret fra de to forskellige signaler. Data is computed allowing an analysis of how much dye-labeled protein the antibodies on each spot are binding. Data er beregnet muliggør en analyse af hvor meget farvestof-mærket protein antistofferne på hver stedet er bindende. This information allows one to determine whether the protein expression is up-regulated in cancer, down-regulated or unchanged. Disse oplysninger tillader en at afgøre, om det protein udtryk er op-reguleret i kræft, ned-reguleres eller uændret.
Figure 2. Figur 2. a) Demonstrates protein arrays which are based on microarray analysis of antigen-antibody interactions. a) påviser protein arrays som er baseret på microarray analyse af antigen-antistof interaktioner. Antigens are spotted onto glass slides. Antigenerne er plettet på glas lysbilleder. Antibodies which are tagged bind to antigens and emit fluorescent signal (shown as the yellow star) which can then be detected from the spot on the array. Antistoffer, der er kodet binder sig til antigener og udsender fluorescerende signal (vist som den gule stjerne), som derefter kan spores fra stedet på array.
b) Shows a protein microarray composed of spots which act as sandwich immunoassays. b) Viser et protein microarray består af vinkler, som fungerer som sandwich-immunanalyser. Antibodies are spotted onto the chips and cell lysate or a solution is applied to the slide. Antistoffer er plettet på chips og celle lysate eller en løsning er anvendt på dias. Antibodies are incubated with the solution, with later washing to remove non-specific binding. Antistoffer inkuberes med den løsning, med senere afvaskning at fjerne ikke-specifik binding. The sandwich complexes formed emit a detectable signal from the spot. Den sandwich komplekser dannet udsender en påviselig signal fra stedet.
c) A protein-protein interaction protein microarray where proteins are spotted onto a protein chip, and labeled proteins are added to the chip and incubated to determine where they may bind and interact. c) et protein-protein interaktion protein microarray hvor proteiner er plettet på et protein chip, og stemplet proteiner er føjet til chip og rugede at fastslå, hvor de kan binde og interagerer på. A detectable signal is emitted from binding spots. En påviselige signal udsendes fra bindende vinkler.
d) Nucleic Acid-protein interaction array, (here a DNA-protein interaction chip). d) Nucleic Acid-protein interaktion array, (her en DNA-protein interaktion chip). Nucleic acids such as DNA are spotted onto a glass slide. Nukleinsyrer såsom DNA er plettet på en glas-slide. This could be transcriptional binding sites for example. Proteins such as fluorescently labeled DNA-binding transcription factors in solution are added to the chip and incubated on the array. Dette kunne være transskriptionel bindende websteder for eksempel. Proteiner såsom fluorescently mærket DNA-bindende transkription faktorer i opløsning tilføjes til chip og rugede på array. A detectable signal is emitted from the DNA spots where the proteins bind. En påviselige signal udsendes fra DNA-spots, hvor proteiner binder.
e) If you have a set of ligands and you want to find the receptors the bind to, you can use a receptor-ligand protein chip as displayed. Receptor proteins are spotted on glass slides. e) Hvis du har et sæt ligands og du ønsker at finde de receptorer de binder sig til, kan du bruge en receptor-ligand protein chip som vises. receptor proteiner er plettet af glas lysbilleder. Fluorescently labeled ligands are added to the chip. Fluorescently stemplet ligands tilføjes til chip. Binding of ligand to receptors causes the emission of a detectable signal which pinpoints the interacting spots (ie which protein did the ligand bind to). Bindingen af ligand til receptorer medfører emission af en påviselig signal, som peger på de interagere pletter (dvs. som protein gjorde liganden binder til).
f) To test for enzyme-subrates specificity one can employ an enzyme-substrate protein microarray. f) At prøve for enzym-subrates specificitet man kan ansætte en enzym-substrat protein microarray. This chip is composed of descrete nano-wells in which enzymes are bound. Denne chip er sammensat af descrete nano-brønde, hvor enzymer er bundet af. Substrate is added into the nano-wells and signal emission is detected from the nano-wells in order to assay for enzyme function. Bærer indsættes i nano-brønde og signal-emission er opdaget fra nano-brønde for at assay for enzymets funktion.
&nbs�ÊM:p> & nbsÊM: p>
![[أربيك]](http://www.microarraystation.com/translate/images/flag_ar.gif){kind=small}
