Primer and Oligo Design Tools Primer og oligo Design Tools
Primer Design Tools and Oligo Software : Primer Design Tools og oligo Software:
Software, programs, and online bioinformatic tools for the design of primers and oligonucleotides. Software, programmer og online Bioinformatic værktøjer til design af primere og oligonucleotides.
We recommend the following: Vi anbefaler følgende:
Array Designer Premier Biosoft International. Array Designer Premier Biosoft International. Software which can design primers for DNA or oligo arrays. Software, der kan designe primere til DNA eller oligo arrays.
Beacon Designer Premier Biosoft International. Beacon Designer Premier Biosoft International.
OligoArray2.1 OligoArray 2.0 and the new version 2.1 are free software packages that compute gene specific oligonucleotides for OligoArray2.1 OligoArray 2,0 og den nye version 2,1 er fri software pakker, compute-genet specifikke oligonucleotides for
genome-scale oligonucleotide microarray construction. genom-skala oligonukleotide microarray byggeri. Reference [ PubMed ] Free Reference [PubMed] Gratis
Oligodb - Oligodb is a web-based program for the interactive design of DNA oligos for transcription profiling and hybridization of human genes. Oligodb - Oligodb er et web-baseret program for interaktivt design af DNA-oligos for transskription profilering og krydsning af menneskelige gener. The oligodb program determine oligos using human DNA-transcript data from ENSEMBL. De oligodb program afgøre oligos anvendes humane DNA-udskrift data fra ENSEMBL. Reference [ PubMed ][ pdf ] Reference [PubMed] [pdf]
OligoPicker - OligoPicker can select up to five oligo probes for each of the DNA sequences you provide for microarray spotting. OligoPicker - OligoPicker kan vælge op til fem oligo-sonder for hver af de DNA-sekvenser, du giver til microarray genkendelse. Reference [ PubMed ] Free Reference [PubMed] Gratis
PrimerQuest Free PrimerQuest Gratis
Genome-wide Automated Primer finder servers (GAP) Software which can design thousands of primer pairs to amplify a set of open reading frames (ORFs) covering a whole genome. Free Genom-dækkende Automated Primer Søgevindue servere (GAP) Software, der kan designe tusindvis af primer par til at uddybe et sæt af åbne læse frames (ORFs), der dækker en hel genom. Gratis
Genome PRIDE GenomePRIDE is a primer design software tool that designs PCR primers or long oligos based on annotated sequences. Genom PRIDE GenomePRIDE er en primer design software-værktøj, design PCR primere eller lange oligos baseret på kommenteret sekvenser.
GenomePRIDE has been used for the design of many DNA arrays/chips. Free GenomePRIDE har været anvendt til konstruktion af mange DNA arrays / chips. Gratis
Primer3 Whitehead Institute/MIT Center for Genome Research, Free Primer3 Whitehead Institute / MIT Center for genom-forskning, fri
Primer Premier Premier Biosoft International. Primer Premier Premier Biosoft International.
PRIMEGENS - Primegens (Primer Design Using Gene Specific Fragments) is a computer program which you use selected gene-specific fragments and then it designs primer pairs for PCR amplifications. PRIMEGENS - Primegens (Primer Design Brug Gene Særlige fragmenter) er et edb-program, som du bruger udvalgte gen-specifikke fragmenter og derefter det design primer par til PCR forstærkninger. Reference [ PubMed ] Reference [PubMed]
ProbeWiz Server - The CBS ProbeWiz WWW server predicts optimal PCR primer pairs for generation of probes for cDNA arrays. ProbeWiz Server - CBS ProbeWiz WWW-server forudsiger optimale PCR-primer par for dannelsen af sonder til cDNA arrays. Reference [ PubMed ] Reference [PubMed]
ProMide - ProMide is a collection of command-line tools for Probe selection and Microarray Design. Free ProMide - ProMide er en samling af kommando-linje værktøj til Probe udvælgelse og microarray Design. Gratis
Sarani - Sarani Gold (Genome Oligo Designer) is a software for automatic large-scale design of optimal oligonucleotide probes for microarray experiments. Sarani - Sarani guld (genom oligo Designer) er en software til automatisk storstilet design af optimale oligonukleotide prober for microarray eksperimenter. Thousands of gene sequences can be analyzed together and best available oligonucleotide probes with uniform thermodynamic properties and minimal similarity to non-specific genes can be selected. Tusindvis af gensekvenser kan analyseres sammen og bedste tilgængelige oligonukleotide prober med ensartet termodynamiske egenskaber og minimal lighed med ikke-specifikke gener kan vælges. Product of Strand Genomics . Produkt Strand genomforskning.
STACKdb - The STACKdb, Sequence Tag Alignment and Consensus Knowledgebase, is generated by processing EST and mRNA sequences obtained from Genbank through a pipeline consisting of masking, clustering, alignment and variation analysis steps. STACKdb - STACKdb, Sequence Tag Alignment og konsensus Knowledgebase, der genereres ved forarbejdning EST og mRNA sekvenser indhentet fra Genbank gennem en rørledning, der består af maskering, klyngedannelse, tilpasning og variation analyse trin. The STACKdb database is created using tools called "stackPACK". De STACKdb database er oprettet ved hjælp af værktøj kaldet "stackPACK". Also available through Electric Genetics . Free Også tilgængelig gennem Electric Genetics. Gratis
Visual OMP - Visual OMP picks primers and oligo probes which do not cross hybridize with each other and other targets. Visual OMP - Visual OMP henter primere og oligo-sonder, der ikke krydse krydse sig med hinanden og andre mål. Uses the OMP (Oligonucleotide Modeling Platform) engine, based on scientific research by nucleic acids thermodynamics expert, Dr. John SantaLucia. DNA Software, Inc . Bruger OMP (Oligonucleotide Modeling Platform) motor, baseret på videnskabelig forskning ved nukleinsyrer termodynamik ekspert, Dr. John SantaLucia. DNA Software, Inc.
WebPrimer Free WebPrimer Gratis
Xpression Primer Premier Biosoft International. XPRESSION Primer Premier Biosoft International.
![[أربيك]](http://www.microarraystation.com/translate/images/flag_ar.gif){kind=small}
