Information on DNA Microarrays Oplysninger om DNA Microarrays
DNA Microarrays, an Introduction : DNA Microarrays, en Indledning:
Introduction to Microarrays Introduktion til Microarrays
Availability of whole genomic sequences from many organisms (such as the human genome project) have created the need for high throughput analysis of gene expression patterns. Tilgængelighed af hele genom-sekvenser fra mange organismer (såsom det menneskelige genom projekt) har skabt behovet for en høj overførselshastighed analyse af genekspression mønstre.
DNA microarrays have revolutionized functional and genomic analysis. DNA microarrays har revolutioneret funktionelle og genom-analyse.
The Evolution of the DNA Microarray: Udviklingen af DNA microarray:
In the 1980's, bacterial colonies were spotted on nylon membranes with different genomic inserts or cDNAs I 1980's, bakteriel kolonier blev spottet på nylon membraner med forskellige genomiske indsætter eller cDNA
The 1990's resulted in the emergence of ink-jet spotting methods which allowed the in situ synthesis of 60-mer oligo spots on glass slides. I 1990 har resulteret i fremkomsten af inkjet-spotting metoder, som gjorde det muligt for in situ syntese af 60-mer oligo pletter på glas lysbilleder.
Affymetrix further developed DNA microarrays which were based on high-density 25-mer oligos from human cDNA sequences. Affymetrix videreudvikles DNA microarrays der var baseret på high-density 25-mer oligos fra humane cDNA sekvenser.
Background on DNA Microarrays Baggrund om DNA Microarrays
The basic premise of the DNA microarray is that RNA samples or targets are hybridized to known cDNAs/oligo probes on the arrays. Den grundlæggende forudsætning af DNA microarray er, at RNA prøver eller mål er hybridized til kendte cDNA / oligo-sonder på arrays.
Microarrays were originally designed to measure gene expression levels of a few genes. Microarrays blev oprindeligt udviklet til at måle genekspression niveauer af et par gener. Recently, high density microarrays have been developed which have allowed the global analysis of gene expression or the transcriptome. This global analysis allows one to determine the cellular function of genes, the nature and regulation of biochemical pathways, and the regulatory mechanisms at play during certain signalling conditions or diseases. For nylig, høj massefylde microarrays er blevet udviklet som har tilladt den globale analyse af genekspression eller transcriptome. Denne globale analyse tillader en at bestemme den cellulære funktion af gener, arten og regulering af biokemiske veje, og de regulerende mekanismer på spil i visse signalering betingelser eller sygdomme.
Regulation of Transcription and DNA Microarrays Regulering af Transskription og DNA Microarrays
The Human Genome Project has allowed a vast wealth of information to come into our hands. Det menneskelige genom-projektet har givet et stort væld af informationer til at komme i vores hænder. However, a huge problem is analyzing the new genes and putative regulatory functions of these genes. Men et enormt problem er at analysere de nye gener og putative regulerende funktioner af disse gener. DNA microarray analysis has allowed these newly annotated genes and novel genes to be examined. New regulatory pathways can be examined using DNA microarrays. DNA microarray analyse har tilladt disse nyligt kommenteret gener og nye gener, der skal undersøges. Nye lovgivningsmæssige veje kan undersøges ved hjælp af DNA microarrays. For example, the new gene may be a transcriptional factor. Microarrays can examine the effect that gene has on thousands of genes at a time, under many conditions in a simple and fast manner. For eksempel det nye gen kan være en transskriptionel faktor. Microarrays kan undersøge den virkning, at genet har på tusindvis af gener på et tidspunkt, under mange forhold på en enkel og hurtig måde.
Applications of DNA Microarrays Ansøgninger af DNA-Microarrays
DNA microarrays have been used to examine the gene expression changes under diseases such as cancer. Tumour profiling using DNA microarrays allows the analysis of the development and the progression of such complex diseases. DNA microarrays har været brugt til at undersøge genekspression ændringer i henhold til sygdomme som kræft. Tumor profilering ved hjælp af DNA microarrays tillader analyse af udvikling og progression af disse komplekse sygdomme.
Using DNA microarrays, one can examine targets for drug discovery and potential diagnostic and prognostic biomarkers for many complex diseases. Brug af DNA microarrays, kan man undersøge mål for lægemiddeludvikling og potentielle diagnostiske og prognostic biomarkører for mange komplekse sygdomme.
DNA microarrays are used commonly to detect viruses and other pathogens from blood samples and thus can be used as a pathogen detection method. DNA microarrays bruges almindeligvis til at opdage vira og andre patogener fra blodprøver og kan således bruges som et patogen påvisningsmetode.
DNA microarrays have been more recently used to identify inheritable markers, and therefore have been used as a genotyping tool. DNA microarrays have været mere nylig bruges til at identificere arvelige markører, og derfor er blevet anvendt som en genotypebestemmelse værktøj.
SNP chips based on DNA microarray technology have allowed the high throughput profiling of single nucleotide polymorphisms using a chip or array approach. This has allowed polymorphisms to be more quickly assayed and also their relavence to disease to be easily determined. SNP chips baseret på DNA microarray teknologi har gjort det muligt for høj overførselshastighed profilering af en enkelt nukleotid polymorfismer ved hjælp af en chip eller array tilgang. Dette har tilladt polymorfismer at være hurtigere assay og også deres relavence at sygdommen skal være umiddelbart bestemmes.
Advantages of DNA Microarrays Fordele ved DNA Microarrays
DNA microarrays are better than other profiling methods (such as SAGE, SH, PCR methods) in that they are: DNA microarrays er bedre end andre profilering metoder (såsom salvie, SH, PCR-metoder), idet de er:
- easier to use -- Lettere at bruge
- are high-throughput (can analyze thousands of genes or markers at a time) -- Er høj overførselshastighed (kan analysere tusindvis af gener eller markører på et tidspunkt)
- generate large amounts of data in little time -- Generere store mængder af data i lidt tid
- do not require large-scale sequencing -- Ikke kræver stor-skala sekventering
- allow the quantitation of thousands of genes from many samples -- Gøre det muligt at quantitation af tusindvis af gener fra mange prøver
![[أربيك]](http://www.microarraystation.com/translate/images/flag_ar.gif){kind=small}
