Protein Microarrays Protein Microarrays
Visit Molecular Station for a great article on Antibody and Protein Microarrays Navštivte molekulární stanice pro velký článek o Antibody a Protein Microarrays
Protein Chips: Bílkoviny Chips:
Protein Microarrays can be based on any ligand-binding assay that relies on the formation of product with an immobilized capture molecule and a target molecule present in the solution. Protein Microarrays může být založena na jakékoli ligand-závazné testu, která závisí na tvorbě produktu s znehybněné zachycování molekul a cílové molekuly přítomné v roztoku. These assays can be miniturized and placed on a protein microarray chip. Tyto testy mohou být miniturized a umístí na bílkoviny Microarray čipu.
Protein microarrays are now becoming very popular due to their possible future applications in the study of nucleic acid-protein, protein-protein, ligand-receptor, drug-protein target, and enzyme-substrate interactions. Protein microarrays se nyní stává velmi populární díky své případné budoucí aplikace při studiu nukleových kyselin-protein, protein-protein, ligand-receptor, drogová-bílkoviny cíl, a enzym-substrát interakcí.
Types of Capture Molecules for Protein Microarray Chips. Typy na zachytávání molekul bílkovin Microarray Chips. To analyze protein interactions with other molecules, protein microarrays can have various types of molecules immobilized on the slide surface to act as capture molecules in the protein microarray assay. K analýze proteinových interakcí s jinými molekulami, proteinových microarrays může mít různé typy molekul znehybněné na tento snímek povrch působí jako zachycování molekul bílkovin v Microarray rozboru.
Figure 1 Illustrates the most common protein array, the antibody microarray. Obrázek 1 ilustruje nejčastější bílkovin pole, protilátky Microarray. Antibodies are spotted onto a glass slide. Protilátky se nanese na skleněné sklíčko. Two cell lysates with proteins labeled with Cy3 and Cy5 (for example, cancer vs normal) are added as a solution onto the protein array. Dva buněčné lyzáty s proteiny označeny Cy3 a Cy5 (například rakovina vs normální), která znějí jako řešení do pole bílkovin. Signals are detected from the two different signals. Signály jsou zjištěny z dvou různých signálů. Data is computed allowing an analysis of how much dye-labeled protein the antibodies on each spot are binding. Data jsou počítány umožňující analýzu toho, jak moc barevna-označeném bílkovin protilátky na každém místě jsou závazné. This information allows one to determine whether the protein expression is up-regulated in cancer, down-regulated or unchanged. Tato informace umožňuje jedné zjistit, zda je bílkovina vyjádření je do-upravena v rakoviny, stanoví-regulovaném nebo nezměněna.
Figure 2. Obrázek 2. a) Demonstrates protein arrays which are based on microarray analysis of antigen-antibody interactions. a) prokáže, bílkovin pole, které jsou založeny na Microarray analýza interakcí antigen-protilátka. Antigens are spotted onto glass slides. Antigeny se nanese na skleněné diapozitivy. Antibodies which are tagged bind to antigens and emit fluorescent signal (shown as the yellow star) which can then be detected from the spot on the array. Protilátky, které jsou označené váží na antigeny a emitovat fluorescenční signál (zobrazen jako žlutá hvězdička), který pak může být zjištěn z místě na poli.
b) Shows a protein microarray composed of spots which act as sandwich immunoassays. b) ukazuje protein Microarray skládá ze spotů, které působí jako sendvič imunologických. Antibodies are spotted onto the chips and cell lysate or a solution is applied to the slide. Protilátky se nanese na čipy a buněčné lysate nebo roztok se aplikuje na sklíčku. Antibodies are incubated with the solution, with later washing to remove non-specific binding. Protilátky se inkubují se na řešení, se později mytí odstranit non-specifické závazné. The sandwich complexes formed emit a detectable signal from the spot. Sendvič komplexy tvořené vyzařování signálů z zjistitelné místě.
c) A protein-protein interaction protein microarray where proteins are spotted onto a protein chip, and labeled proteins are added to the chip and incubated to determine where they may bind and interact. c) protein-proteinových interakcí bílkovin Microarray kde proteiny jsou bílkoviny nanese na čipu, a označené proteiny jsou přidány do čipu a do inkubátoru, aby zjistili, kde se mohou vázat a vzájemně ovlivňují. A detectable signal is emitted from binding spots. Detekovatelné signálu od závazné skvrny.
d) Nucleic Acid-protein interaction array, (here a DNA-protein interaction chip). d) nukleové kyseliny-interakce proteinů pole, (zde DNA-proteinových interakcí čipu). Nucleic acids such as DNA are spotted onto a glass slide. Nukleové kyseliny, jako je DNA se nanese na skleněné sklíčko. This could be transcriptional binding sites for example.˙Proteins such as fluorescently labeled DNA-binding transcription factors in solution are added to the chip and incubated on the array. To by mohlo být transkripční vazebných míst na příkladu. Proteinů, jako jsou fluorescenčně označené DNA-transkripčních faktorů závazné v roztoku se přidávají do čipu a do inkubátoru na poli. A detectable signal is emitted from the DNA spots where the proteins bind. Detekovatelné signálu z DNA spoty, kde se proteiny váží.
e) If you have a set of ligands and you want to find the receptors the bind to, you can use a receptor-ligand protein chip as displayed.˙ Receptor proteins are spotted on glass slides. e) Pokud máte sadu ligandy a chcete najít receptory za BIND, můžete použít receptor-ligand bílkovin čip jako zobrazen. receptoru proteiny jsou nanese na skleněné diapozitivy. Fluorescently labeled ligands are added to the chip. Fluorescenčně označené ligandy, které znějí na čipu. Binding of ligand to receptors causes the emission of a detectable signal which pinpoints the interacting spots (ie which protein did the ligand bind to). Vazba na receptory ligand způsobuje emise detekovatelné signál, který upozorňuje na interakci skvrny (tj. bílkovin, které jste ligand vázat k).
f) To test for enzyme-subrates specificity one can employ an enzyme-substrate protein microarray. f) Pro test na enzym-subrates specifičnost lze zaměstnávat enzym-substrát bílkovin Microarray. This chip is composed of descrete nano-wells in which enzymes are bound. Tento čip je složen z descrete nano-studní v enzymy, které jsou vázány. Substrate is added into the nano-wells and signal emission is detected from the nano-wells in order to assay for enzyme function. Nosič se vkládá do nano-studní a signál je detekován emisí z nano-studní, aby se zkouška pro funkci enzymu.
&nbs�ÊM:p> & nbsÊM: p>
![[أربيك]](http://www.microarraystation.com/translate/images/flag_ar.gif){kind=small}
