Primer and Oligo Design Tools Primer a oligo Design Nástroje
Primer Design Tools and Oligo Software : Primer Design Nástroje a oligo Software:
Software, programs, and online bioinformatic tools for the design of primers and oligonucleotides. Software, programy, a on-line bioinformačních nástrojů pro design primerů a oligonucleotides.
We recommend the following: Doporučujeme následující:
Array Designer Premier Biosoft International. Array Designer Premier Biosoft International. Software which can design primers for DNA or oligo arrays. Software, který může navrhnout primery pro DNA nebo oligo pole.
Beacon Designer Premier Biosoft International. Beacon Designer Premier Biosoft International.
OligoArray2.1 OligoArray 2.0 and the new version 2.1 are free software packages that compute gene specific oligonucleotides for OligoArray2.1 OligoArray 2,0 a 2,1 jsou nové verze zdarma softwarové balíky, které počítají genů specifických pro oligonucleotides
genome-scale oligonucleotide microarray construction. genomu-měřítku oligonukleotidové Microarray výstavby. Reference [ PubMed ] Free Reference [PubMed] Free
Oligodb - Oligodb is a web-based program for the interactive design of DNA oligos for transcription profiling and hybridization of human genes. Oligodb - Oligodb je on-line program pro interaktivní návrh oligos pro přepis DNA profilů a hybridizace lidských genů. The oligodb program determine oligos using human DNA-transcript data from ENSEMBL. Na oligodb program zjistit oligos pomocí lidské DNA-přepis údajů z ENSEMBL. Reference [ PubMed ][ pdf ] Reference [PubMed] [pdf]
OligoPicker - OligoPicker can select up to five oligo probes for each of the DNA sequences you provide for microarray spotting. OligoPicker - OligoPicker můžete vybrat až pět oligo sond pro každé ze sekvencí DNA, které poskytnete na Microarray detekce. Reference [ PubMed ] Free Reference [PubMed] Free
PrimerQuest Free PrimerQuest Volný
Genome-wide Automated Primer finder servers (GAP) Software which can design thousands of primer pairs to amplify a set of open reading frames (ORFs) covering a whole genome. Free Genomu-široký Automatizovaný Primer vyhledávač serverů (GAP) software, který může navrhnout tisíce párů primerů doplnit soubor otevřít čtení rámy (ORFs), který pokrývá celý genom. Svobodný
Genome PRIDE GenomePRIDE is a primer design software tool that designs PCR primers or long oligos based on annotated sequences. Genomu Pride GenomePRIDE je základní konstrukce softwarový nástroj, aby vzory, PCR primery nebo dlouhé oligos založené na komentovaný sekvencí.
GenomePRIDE has been used for the design of many DNA arrays/chips. Free GenomePRIDE byl použit pro návrh na mnoha DNA pole / žetony. Svobodný
Primer3 Whitehead Institute/MIT Center for Genome Research, Free Primer3 Whitehead ústav / MIT Centrum pro výzkum genomu, Volný
Primer Premier Premier Biosoft International. Primer Premier Premier Biosoft International.
PRIMEGENS - Primegens (Primer Design Using Gene Specific Fragments) is a computer program which you use selected gene-specific fragments and then it designs primer pairs for PCR amplifications. PRIMEGENS - Primegens (Primer Design Použití Gene Zvláštní Fragments) je počítačový program, který jste použil vybraných genů-specifické fragmenty a pak to vzorů páry primerů pro PCR amplifications. Reference [ PubMed ] Reference [PubMed]
ProbeWiz Server - The CBS ProbeWiz WWW server predicts optimal PCR primer pairs for generation of probes for cDNA arrays. ProbeWiz Server - CBS ProbeWiz WWW server předpokládá optimální PCR primerů párů na generaci sondy na cDNA pole. Reference [ PubMed ] Reference [PubMed]
ProMide - ProMide is a collection of command-line tools for Probe selection and Microarray Design. Free ProMide - ProMide je kolekce příkaz-line nástrojů pro výběr sondy a Microarray Design. Svobodný
Sarani - Sarani Gold (Genome Oligo Designer) is a software for automatic large-scale design of optimal oligonucleotide probes for microarray experiments. Sarani - Sarani Gold (genomu oligo Designer) je software pro automatické velkého rozsahu-design optimální oligonukleotidové sondy pro Microarray experimentů. Thousands of gene sequences can be analyzed together and best available oligonucleotide probes with uniform thermodynamic properties and minimal similarity to non-specific genes can be selected. Tisíce sekvence genu může být analyzována společně a nejlepší dostupné oligonukleotidové sondy s jednotným termodynamické vlastnosti a minimální podobnost s non-specifických genů může být vybrána. Product of Strand Genomics . Produkt Strnad Genomika.
STACKdb - The STACKdb, Sequence Tag Alignment and Consensus Knowledgebase, is generated by processing EST and mRNA sequences obtained from Genbank through a pipeline consisting of masking, clustering, alignment and variation analysis steps. STACKdb - V STACKdb, pořadové Tag Orientace a konsensus Knowledgebase, je vzniklý na základě zpracování EST a mRNA sekvence získané z Genbank prostřednictvím ropovodu sestávající z maskování, shlukování, srovnávání a variační analýzy kroků. The STACKdb database is created using tools called "stackPACK". Na STACKdb databáze je vytvořena pomocí nástroje s názvem "stackPACK". Also available through Electric Genetics . Free Také k dispozici prostřednictvím Electric genetiky. Svobodný
Visual OMP - Visual OMP picks primers and oligo probes which do not cross hybridize with each other and other targets. Visual OMP - Visual OMP česat primery a oligo sond, které nejsou v křížové křížit mezi sebou navzájem a jiné cíle. Uses the OMP (Oligonucleotide Modeling Platform) engine, based on scientific research by nucleic acids thermodynamics expert, Dr. John SantaLucia. DNA Software, Inc . Používá OMP (oligonukleotidové Modeling Platform) motoru, založené na vědeckém výzkumu nukleových kyselin termodynamika odborník, Dr. John SantaLucia. DNA Software, Inc.
WebPrimer Free WebPrimer Volný
Xpression Primer Premier Biosoft International. Xpression Primer Premier Biosoft International.