Information on DNA Microarrays Informace o DNA Microarrays
DNA Microarrays, an Introduction : DNA Microarrays, An Introduction:
Introduction to Microarrays Úvod do Microarrays
Availability of whole genomic sequences from many organisms (such as the human genome project) have created the need for high throughput analysis of gene expression patterns. Dostupnost celé genomické sekvence z mnoha organismů (např. projekt lidského genomu), vytvořily potřebu vysoce výkonných analýza genové exprese vzory.
DNA microarrays have revolutionized functional and genomic analysis. DNA microarrays mít revoluci funkční a genomické analýzy.
The Evolution of the DNA Microarray: Vývoj DNA Microarray:
In the 1980's, bacterial colonies were spotted on nylon membranes with different genomic inserts or cDNAs V roku 1980 je, bakteriální kolonie byly nanese na nylonové membrány s různými genomické vložky nebo cDNAs
The 1990's resulted in the emergence of ink-jet spotting methods which allowed the in situ synthesis of 60-mer oligo spots on glass slides. Z roku 1990 je za následek vznik inkoust-jet detekce metody, které umožnily, aby v místě syntézy 60-mer oligo skvrny na skleněných diapozitivů.
Affymetrix further developed DNA microarrays which were based on high-density 25-mer oligos from human cDNA sequences. Affymetrix dále rozvíjet DNA microarrays, které byly založeny na vysoké hustoty-25-mer oligos z lidské cDNA sekvencí.
Background on DNA Microarrays Pozadí na DNA Microarrays
The basic premise of the DNA microarray is that RNA samples or targets are hybridized to known cDNAs/oligo probes on the arrays. Základním předpokladem je, že DNA Microarray RNA vzorků nebo cíle jsou hybridized známých cDNAs / oligo sondy na pole.
Microarrays were originally designed to measure gene expression levels of a few genes. Microarrays byly původně navrženy pro měření úrovně genové exprese několika genů. Recently, high density microarrays have been developed which have allowed the global analysis of gene expression or the transcriptome.ÿ This global analysis allows one to determine the cellular function of genes, the nature and regulation of biochemical pathways, and the regulatory mechanisms at play during certain signalling conditions or diseases. V poslední době vysokou hustotou microarrays byly vyvinuty, které mají povoleno globální analýzu genové exprese nebo transcriptome. Tento globální analýza umožňuje jedné určit buněčné funkce genů, povaha a regulace biochemických cest, a regulační mechanismy ve hře během určitých signalizace podmínky nebo nemocí.
Regulation of Transcription and DNA Microarrays Regulace transkripce a DNA Microarrays
The Human Genome Project has allowed a vast wealth of information to come into our hands. Lidském genomu Projekt umožnil obrovské množství informací, aby přišli do našich rukou. However, a huge problem is analyzing the new genes and putative regulatory functions of these genes. Nicméně, obrovský problém je analýzou nových genů a zdánlivý regulační funkce těchto genů. DNA microarray analysis has allowed these newly annotated genes and novel genes to be examined.ÿ New regulatory pathways can be examined using DNA microarrays. DNA Microarray analýza umožnila tyto nově komentovaný genech a nových genů, které mají být prozkoumány. Nových regulačních cest mohou být vyšetřeni pomocí DNA microarrays. For example, the new gene may be a transcriptional factor.ÿ Microarrays can examine the effect that gene has on thousands of genes at a time, under many conditions in a simple and fast manner. Například nové genu může být transkripční faktor. Microarrays lze posuzovat vliv genu, který má na tisíce genů najednou, podle mnoha podmínek na jednoduchý a rychlý způsob.
Applications of DNA Microarrays Žádosti o DNA Microarrays
DNA microarrays have been used to examine the gene expression changes under diseases such as cancer.ÿ Tumour profiling using DNA microarrays allows the analysis of the development and the progression of such complex diseases. DNA microarrays byly použity k posoudí změny exprese genů v rámci onemocnění jako je rakovina. Nádorů pomocí profilování DNA microarrays umožňuje analýzu vývoje a progrese těchto složitých onemocnění.
Using DNA microarrays, one can examine targets for drug discovery and potential diagnostic and prognostic biomarkers for many complex diseases. Pomocí DNA microarrays, je možné zkoumat cíle pro léčiv a potenciální diagnostické a prognostické biomarkery pro řadu složitých onemocnění.
DNA microarrays are used commonly to detect viruses and other pathogens from blood samples and thus can be used as a pathogen detection method. DNA microarrays jsou běžně používány k detekci virů a dalších patogenů z krevních vzorků a může tak být použit jako metoda detekce patogenu.
DNA microarrays have been more recently used to identify inheritable markers, and therefore have been used as a genotyping tool. DNA microarrays byly v poslední době se používá k identifikaci dědičné znaky, a proto byly použity jako nástroj genotypizace.
SNP chips based on DNA microarray technology have allowed the high throughput profiling of single nucleotide polymorphisms using a chip or array approach.ÿ This has allowed polymorphisms to be more quickly assayed and also their relavence to disease to be easily determined. SNP čipů založených na DNA Microarray technologie umožnily vysokou průchodností profilování jediného nukleotidů polymorfismů pomocí čipu nebo pole přístup. Polymorfismů To umožnilo, aby se rychleji obsah a také jejich relavence na nemoc, která má být snadno určit.
Advantages of DNA Microarrays Výhody DNA Microarrays
DNA microarrays are better than other profiling methods (such as SAGE, SH, PCR methods) in that they are: DNA microarrays jsou lepší než ostatní profilovací metody (například šalvěj, SH, PCR metody) v tom, že jsou:
- easier to use -- Snadnější použití
- are high-throughput (can analyze thousands of genes or markers at a time) -- Jsou vysoce-průchodnost (může analyzovat tisíce genů nebo markerů najednou)
- generate large amounts of data in little time -- Vytvářet velké objemy dat v málo času
- do not require large-scale sequencing -- Nevyžadují velké měřítko-řazení
- allow the quantitation of thousands of genes from many samples -- Umožní detekce tisíc genů z mnoha vzorků
![[أربيك]](http://www.microarraystation.com/translate/images/flag_ar.gif){kind=small}
