Microarray Types and Info Microarray видове и инфо

Using Microarrays Използването Microarrays

menu

Tissue Microarrays Тъкан Microarrays

Tissue Microarrays an Introduction : Тъкан Microarrays въведение:

Tissue microarrays (TMAs) are used to analyze the expression of genes simultaneously in multiple individual tissue samples on one slide. Тъкан microarrays (TMAs) се използват за анализиране на изразяване на гени едновременно в няколко отделни тъканни проби от една пързалка. TMAs are composed of small 0.6 - 3.0 mm cores of tissue from donor tissue paraffin blocks which are arrayed at a high density on a slide. TMAs са съставени от малки 0,6 - 3,0 мм накрайници на тъкани от донори тъкан парафинови блокчета, които са подредена най-висока плътност на слайда.

тъкан microarray

Technology Insight: identification of biomarkers with tissue microarray technology Jena M Giltnane and David L Rimm Nature Clinical Practice Oncology (2004) 1, 104-111 Технологии Insight: идентификация на биомаркери с тъкан microarray технология Jena M Giltnane и Дейвид L Rimm Природа клинична практика онкологични заболявания (2004) 1, 104-111

Tissue Microarrays have allowed tissue traditional analysis of conventional histologic paraffin blocks to become miniturized and high-throughput. Тъкан Microarrays позволиха на традиционни тъкани анализ на конвенционалните histologic парафинови блокчета да станат miniturized и висока производителност.

Histochemical and molecular detection techniques can be used on the TMA slides, and thus allow TMAs to be powerful tools to examine gene expression profiling in disease states across a variety of patients and disease conditions. Histochemical и молекулярно откриване техники могат да бъдат използвани за TMA пързалки, и по този начин да позволи на TMAs да бъдат мощни инструменти, за да проучи ген словото профилиране в болест, гласи цяла редица заболявания на пациенти и условия.

Tissue Microarray Contents Тъкан Microarray Съдържание

TMA Introduction TMA Въведение

Characteristics of Tissue Arrays Характеристики на тъканта масиви

Tissue Microarray Synthesis Тъкан Microarray синтез

Applications Заявления

Advantages of TMAs Предимства на TMAs

Types of Tissue Arrays Видове тъкани масиви

Analysis Software Анализ на софтуер

Tissue Chip References Тъкан чип референции

Characteristics of Tissue Microarrays : Характеристики на тъканни Microarrays:

Tissue Microarray Synthesis : Тъкан Microarray синтез:

Tissue Microarrays are produced using a microtome which sections tissue into 4 - 5 micrometer sections (see figure 1 above). Тъкан Microarrays са произведени чрез microtome кои раздели тъкан под 4 - 5 точки статия (виж фигура 1 по-горе). These core tissue biopsy sections are taken from specific areas of interest from paraffin-embedded tissue blocks.  These cynlindrical cores of tissue are re-embedded into an arrayed blank recipient blocks. Тези основни тъкан биопсия секции са взети от специфични области на интерес от парафин-вградена тъкан блокове. Cynlindrical Тези ядра от тъкан, са ре-вграден в една подредена получателя празни блокове. Using this method, more than 500 tissue cores can be arrayed on a single slide! Използвайки този метод, повече от 500 ядра тъкан може да бъде подредена на един слайд! The master block was developed by Konenen et al. Капитанът блок е разработена от Konenen и др.

Applications of Tissue Microarrays : Заявленията на тъканни Microarrays:

ЗУТ

Advantages of Tissue Arrays or Tissue Chips : Предимства на тъканни ред или Тъкан Чипове:

Types of Tissue Microarrays : Видове Тъкан Microarrays:

Cryo - Tissue Microarrays : Cryo-TMAs uses frozen tissues which are embedded in an optimal cutting temperature compound. Cryo - Тъкан Microarrays: Cryo-TMAs използва замразени тъкани, които са вградени в оптимална температура рязане съединение. These cryo-TMAs due to their freezing are superior to formalin fixed tissues for RNA and protein analysis. Тези cryo-TMAs, дължащи се на тяхното замразяване се чувствате на формалин, определени тъкани за РНК и протеини анализ. Also, antibodies work much betterl with frozen tissues. Също така, антитела работят с много по betterl замразени тъкани.

Multi-tumours Tissue Microarrays : multi-tumour TMAs have many different types of tissues aligned on the slide. Multi-тумори Тъкан Microarrays: мулти-тумор TMAs са много различни видове тъкани, успоредни на слайда. The technique was first used by Kononen et al., 1998. Kononen used this type of TMA to detect 6 gene amplifications. Техниката за първи път е използвана от Kononen и др., 1998. Kononen използват този вид TMA за откриване на 6 ген amplifications. p53 expression was also examined in breast cancer tissue. p53 изразяване също бе проверено в рак на гърдата тъкан.

Progression Tissue Microarrays : This type of tissue microarray examines different stages of tumour (or disease) progression within a given organ. Прогресия Тъкан Microarrays: Този тип тъкан microarray разглежда различните етапи на тумора (или болест) прогресиране в рамките на даден орган. For example, examination of tumours in the breast. Така например, изследване на тумори на гърдата. These slides can then be assayed for markers of interest, or biochemical analysis of the samples can be done. Тези пързалки могат да бъдат assayed за маркери на интереси, или биохимични анализ на проби може да бъде направено.

Prognosis Tissue Microarrays : Disease samples such as tumour biopsies can be taken from patients and examined. Прогноза Тъкан Microarrays: Болести на проби, като тумор биопсии могат да бъдат взети и изследвани от пациентите. These samples can be used for clinical follow-ups to monitor the patient's progression. Тези проби могат да бъдат използвани за следните клинични прегледи за наблюдение на пациента прогресия. Data is then analyzed and compared with other clinical data. Данните след това се анализират и в сравнение с други клинични данни.

Tissue Microarray Software and Bioinformatics : Тъкан Microarray софтуер и Биоинформатика:

Software Tools for High-Throughput Analysis of Tissue Microarrays: Image Archiving and Data Analysis Софтуерни инструменти за висока производителност Анализ на тъканни Microarrays: архивиране на изображения и анализ на данните

Contains the following software: Съдържа следния софтуер:

TMA-Deconvoluter and Stainfinder. TMA-Deconvoluter и Stainfinder. The deconvoluter converts raw scoring worksheets from the 3-D Tissue Microarray layout into a 2-D tabulated table format suitable for further data analysis. В deconvoluter преработва суров скоринг работните листа от 3-D Тъкан Microarray оформление в 2-D на всеки участник таблица формат подходящ за допълнителни данни, анализ.

Tissue Array Data Analysis : Software to creating an interactive database for TMA image viewing and data input. Тъкан Array анализ на данните: Софтуер за създаване на интерактивна база данни за TMA изображението при гледане и въвеждане на данни.

TAD : Tissue Array Database Software for Download. ОТ: Тъкан Array база данни софтуер за изтегляне.

TMAJ : set of software tools used to manage Tissue MicroArray (TMA) data and information.. TMAJ: набор от софтуерни инструменти, използвани за управление Тъкан MicroArray (TMA) данни и информация ..

Original Tissue Microarray Reference Papers: Оригиналната тъкан Microarray референтни документи:

Battifora H: The multitumor (sausage) tissue block: novel method for immunohistochemical antibody testing. Battifora H: The multitumor (наденица) тъкан блок: роман immunohistochemical метод за изследване на антитела. Lab Invest 1986, 55:244-248. Lab Инвест 1986, 55:244-248.

Kononen J, Bubendorf L, Kallioniemi A, Barlund M, Schraml P, Leighton S, Torhorst J, Mihatsch MJ, Sauter G, Kallioniemi OP: Tissue microarrays for high-throughput molecular profiling of tumor specimens. Kononen J, Bubendorf L, Kallioniemi А, Barlund M, Schraml P, Лейтън S, Torhorst J, Mihatsch MJ, Sauter G, Kallioniemi ОП: Тъкан microarrays за висока производителност молекулярен профил на тумор екземпляри. Nat Med 1998, 4:844-847. Нац Мед 1998 г., 4:844-847.