Information on DNA Microarrays Информация за ДНК Microarrays
DNA Microarrays, an Introduction : ДНК Microarrays, въведение:
Introduction to Microarrays Въведение в Microarrays
Availability of whole genomic sequences from many organisms (such as the human genome project) have created the need for high throughput analysis of gene expression patterns. Наличие на целия genomic последователности от много организми (като човешкия геном страници) са създадени за нуждата от висока производителност анализ на генното изразяване мотиви.
DNA microarrays have revolutionized functional and genomic analysis. ДНК microarrays са revolutionized функционални и genomic анализ.
The Evolution of the DNA Microarray: Еволюцията на ДНК Microarray:
In the 1980's, bacterial colonies were spotted on nylon membranes with different genomic inserts or cDNAs През 1980's, бактериални колонии са петниста върху найлон мембрани с различни genomic вписвания или cDNAs
The 1990's resulted in the emergence of ink-jet spotting methods which allowed the in situ synthesis of 60-mer oligo spots on glass slides. От 1990 г. на довело до появата на мастилено-струйните spotting методи, които позволиха на място синтеза на 60-mer oligo петна върху стъкло пързалки.
Affymetrix further developed DNA microarrays which were based on high-density 25-mer oligos from human cDNA sequences. Affymetrix доразвита microarrays ДНК, които са основани на висока плътност 25-mer oligos от човешка cDNA последователности.
Background on DNA Microarrays Фон на ДНК Microarrays
The basic premise of the DNA microarray is that RNA samples or targets are hybridized to known cDNAs/oligo probes on the arrays. Основното помещение на ДНК, РНК microarray е, че пробите или цели са hybridized да знае cDNAs / oligo вероятно на масиви.
Microarrays were originally designed to measure gene expression levels of a few genes. Microarrays първоначално са били предназначени за измерване на генното изразяване на няколко нива на гени. Recently, high density microarrays have been developed which have allowed the global analysis of gene expression or the transcriptome. This global analysis allows one to determine the cellular function of genes, the nature and regulation of biochemical pathways, and the regulatory mechanisms at play during certain signalling conditions or diseases. Наскоро, с висока плътност microarrays са разработени, които позволиха на глобалния анализ на генното изразяване или transcriptome. Това позволява на един глобален анализ за определяне на клетъчна функция на гени, на природа и регулиране на биохимичните пътища, както и регулаторните механизми в игра по време на някои сигнализация условия или болести.
Regulation of Transcription and DNA Microarrays Регламент на Транскрипция и ДНК Microarrays
The Human Genome Project has allowed a vast wealth of information to come into our hands. Човешките Genome Проектът е разрешено голяма богатството на информация, да влизат в нашите ръце. However, a huge problem is analyzing the new genes and putative regulatory functions of these genes. Въпреки това, огромен проблем е, анализиране на нови гени и putative регулаторните функции на тези гени. DNA microarray analysis has allowed these newly annotated genes and novel genes to be examined. New regulatory pathways can be examined using DNA microarrays. Microarray ДНК анализ е позволил тези нови и нови гени, обозначени гени, които трябва да бъдат разгледани. Нова регулаторна пътеки може да бъде проверено чрез ДНК microarrays. For example, the new gene may be a transcriptional factor. Microarrays can examine the effect that gene has on thousands of genes at a time, under many conditions in a simple and fast manner. Така например, новите ген може да бъде transcriptional фактор. Microarrays може да разглежда в смисъл, че ген е на хиляди гени в даден момент, при условия, много по прост и бърз начин.
Applications of DNA Microarrays Заявленията на ДНК Microarrays
DNA microarrays have been used to examine the gene expression changes under diseases such as cancer. Tumour profiling using DNA microarrays allows the analysis of the development and the progression of such complex diseases. ДНК microarrays са били използвани, за да изследва промените в гена словото заболявания като рак. Тумор профилиране microarrays позволява използването на ДНК анализ на развитието и прогресията на такива сложни заболявания.
Using DNA microarrays, one can examine targets for drug discovery and potential diagnostic and prognostic biomarkers for many complex diseases. Използване на ДНК microarrays, може да се разглежда цели за откриване на наркотици и потенциал за диагностика и прогностична биомаркери за много сложни заболявания.
DNA microarrays are used commonly to detect viruses and other pathogens from blood samples and thus can be used as a pathogen detection method. ДНК microarrays се използват често за откриване на вируси и други кръвни проби от патогени и по този начин може да се използва като метод за откриване патоген.
DNA microarrays have been more recently used to identify inheritable markers, and therefore have been used as a genotyping tool. ДНК microarrays са по-скоро се използва за идентификация inheritable маркери, и следователно са били използвани като инструмент за генотипа.
SNP chips based on DNA microarray technology have allowed the high throughput profiling of single nucleotide polymorphisms using a chip or array approach. This has allowed polymorphisms to be more quickly assayed and also their relavence to disease to be easily determined. SNP чипове на базата на ДНК технология microarray са позволени високата производителност профилиране на едно-единствено нуклеотидни полиморфизми с чип или масив подход. Полиморфизми Това е позволил да бъде по-бързо assayed, а също и техните relavence за болестта да бъдат лесно определени.
Advantages of DNA Microarrays Предимства на ДНК Microarrays
DNA microarrays are better than other profiling methods (such as SAGE, SH, PCR methods) in that they are: ДНК microarrays са по-добре, отколкото другите методи за профилиране (като спанак, SH, PCR методите), че те са в:
- easier to use -- Лесен за използване
- are high-throughput (can analyze thousands of genes or markers at a time) -- Са с висока производителност (можете да анализирате хиляди гени или маркери в даден момент)
- generate large amounts of data in little time -- Генериране на големи количества данни в малко време
- do not require large-scale sequencing -- Не се нуждаят от голям мащаб секвениране
- allow the quantitation of thousands of genes from many samples -- Quantitation позволи на хиляди гени от много проби
![[أربيك]](http://www.microarraystation.com/translate/images/flag_ar.gif){kind=small}
